ചന്ദ്രഗിരി ശ്രീശാസ്താ & തൃക്കണ്ണാട് ത്രയംബകേശ്വര ദേവസ്വം മലബാർ ദേവസ്വം ബോർഡ് കാസറഗോഡ് ഡിവിഷന്‍റെ കീഴിലാണ്. വള്ളിയോടൻ, മേലത്ത്, ഇടയില്ല്യം എന്നീ മൂന്ന് നായർ തറവാടുകളിലെ മുതിർന്ന അംഗങ്ങൾ ഉൾപ്പെടുന്ന മൂന്ന് പാരമ്പര്യട്രസ്റ്റിമാരും, സർക്കാർ നിയമിക്കുന്ന രണ്ടു പാരമ്പര്യേതര ട്രസ്റ്റിമാരും അടങ്ങുന്നതാണ് ക്ഷേത്രഭരണസമിതി. ദൈനംദിന ക്ഷേത്രഭരണം മലബാര്‍ ദേവസ്വം ബോർഡ് നിയമിക്കുന്ന എക്സിക്യൂട്ടീവ് ഓഫീസറാണ് നടത്തിവരുന്നത്.
ക്ഷേത്ര താന്ത്രിക അവകാശം ഒന്നിടവിട്ട കൊല്ല വർഷങ്ങളിൽ ഉച്ചിലത്ത്, ഉളിയത്ത് ഇല്ലങ്ങൾക്കാണ്.